目前上市公司收購一般采取的協(xié)議收購方式，存在著許多弊端和不足，其嚴重性正日益顯露出來。主要表現(xiàn)在：
　　1.上市公司股份協(xié)議收購中行政色彩濃厚，許多地方政府為了保住局部利益，違背市場規(guī)律，導(dǎo)致很多上市公司協(xié)議收購案的形成都是“拉郎配”的結(jié)果。這樣，既沒有使得包袱企業(yè)能夠脫胎換骨，反而拖累了優(yōu)勢企業(yè)。
　　2.非等價交易現(xiàn)象嚴重存在，一時間欺詐性重組行為比比皆是。
　　3.由于收購協(xié)議通常是收購方和目標企業(yè)的管理層私下形成的，缺乏外部監(jiān)督，透明度很差，所以其中的自我交易和利益轉(zhuǎn)移行很容易侵害中小股東和債權(quán)人的合法權(quán)益。
　　4.某些莊家或主力機構(gòu)利用上市公司的重組題材，進行內(nèi)幕交易和“黑箱作業(yè)”，借機瘋狂炒作，造成股價大幅波動，不利于切實維護廣大投資者的合法權(quán)益，難以維持一個公平、透明的市場運行秩序。
　　5.信息披露制度建設(shè)顯得較為滯后。上市公司有關(guān)資產(chǎn)重組的信息披露不夠充分，運作的透明度不高，導(dǎo)致上市公司信息披露的真實性、準確性和完整性難以保障，這容易引發(fā)上市公司和投資者之間因信息的不完全和不對稱而產(chǎn)生“逆向選擇”和 “道德風(fēng)險”等機會主義行為。
　　6.對劣質(zhì)資產(chǎn)的剝離往往使債權(quán)失去應(yīng)有的保障。
　　7.上市公司為了達到配股資格線或保住“殼資源”而進行的報表性資產(chǎn)重組現(xiàn)象較為普遍。
　　8.目前上市公司資產(chǎn)重組中有些只是為了粉飾財務(wù)狀況而進行了報表性重組，并沒有進行實質(zhì)性的資產(chǎn)重組。